Anne Mahoney, Overview of Latin Syntax

Indicative

• “Apud Helvetios longe nobilissimus fuit Orgetorix.” Caesar, BG 1.2
• “Odi et amo.” Catullus 85.1

Clauses with “cum” take the indicative when the “cum-”clause says when the main clause happens or happened. AG 545

• “Helvetii fere cotidianis proeliis cum Germanis contendunt, cum ipsi in eorum finibus bellum gerunt.” Caesar, BG 1.1

• “Tu solebas
  meas esse aliquid putare nugas
  iam tum cum ausus es unus Italorum
  omne aevum tribus explicare chartis.
  

  ”

  Catullus 1.3-6

• “Mimi ergo iam exitus, non fabulae, in quo cum clausula non invenitur, fugit aliquis e manibus, dein scabilla concrepant, aulaeum tollitur” Cicero, Cael. 65

Simple conditional sentences take the indicative in both protasis and apodosis. These include the "future more vivid." AG 514, 515, 516

• “Si pacem populus Romanus cum Helvetiis faciet, in eam partem ibunt atque ibi erunt Helvetii.” Caesar, BG 1.13.

• “Cenabis bene, mi Fabulle, apud me
  paucis, si di te favent diebus,
  si tecum attuleris bonam atque magnam
  cenam.
  

  ”

  Catullus 13.1-4

• “Non iubeo, sed, si me consulis, suadeo.” Cicero, Catil. 1.13

• “Equidem per litora certos
  dimittam et Libyae lustrare extrema iubebo,
  si quibus eiectus silvis aut urbibus errat.
  

  ”

  Virgil, Aen. 1.576-578

Relative clauses normally take the indicative. AG 304

• “Gallia est omnis divisa in partes tres, quarum unam incolunt Belgae.” Caesar, BG 1.1
• “Passer mortuus est, quem plus illa oculis suis amabat.” Catullus 3.3-5

Causal clauses with “quia” or “quod” normally take the indicative. AG 540

• “Helvetii reliquos gallos virtute praecedunt, quod fere cotidianis proeliis cum Germanis contendunt.” Caesar, BG 1.1
• “Nam quod scriptorum non magna est copia apud me, hoc fit quod Romae vivimus.” Catullus 68.34-35